在临床试验中，卡博替尼最常见的（发生率＞20%）的副作用和不良反应有： 腹泻、口腔炎、手足皮肤综合征（PPES）、体重下降、食欲不振、恶心、乏力、口腔疼痛、头发变色、味觉障碍、高血压、腹痛、便秘。 临床试验中，卡博替尼导致的最常见的（发生率＞25%）实验室指标异常有： AST升高，ALT升高，淋巴细胞减少，ALP升高，低钙血症，中性粒细胞减少，血小板减少，低磷血症，高胆红素血症。 临床试验中，卡博替尼最常见的（发生率＞5%）3~4级副作用和不良反应有： 腹泻，手足皮肤综合征（PPES），淋巴细胞减少，低血钙症，疲劳，高血压，乏力，ALT升高，体重下降，口腔炎，食欲不振。 卡博替尼最常见的导致永久停药的副作用和不良反应有： 低钙血症，脂肪酶升高，手足皮肤反应（PPES），腹泻，疲劳，高血压，恶心，胰腺炎，形成气管瘘和呕吐。